Η Ε.Μ.ΒΙ.Ε.Ε. περιλαμβάνει τρεις Ερευνητικές Μονάδες:
- Μονάδα Βασικής και Μεταφραστικής Έρευνας (Μονάδα ΒΜΕ)
- Μονάδα Κλινικών Ερευνών (Μονάδα ΚΕ)
- Μονάδα Ιατρικής Ακριβείας (Μονάδα ΙΑΚ)
Οι τρεις Μονάδες θα στελεχωθούν αρχικά από το υπάρχον ανθρώπινο δυναμικό των εμπλεκόμενων Τμημάτων του ΑΠΘ, από ακαδημαϊκούς υποτρόφους, μεταπτυχιακούς φοιτητές, υποψήφιους διδάκτορες, επιστήμονες που συμμετέχουν σε μετεκπαιδευτικά προγράμματα εξειδίκευσης (fellows), από μεταδιδάκτορες και έναν μικρό αρχικά αριθμό νέων ερευνητών. Η αλληλεπίδραση αυτών των ομάδων θα δώσει καθοριστική ώθηση στην ιατροβιολογική έρευνα αιχμής.